工業工程系于2014年6月24日成立系友會，2016年12月25日經清華校友總會批準成為清華校友總會工業工程系分會，簡稱為“清華工業工程系校友會”（官方微信號“THU-IE”）。校友會是由清華大學工業工程系校友自愿聯合的非營利性會員組織，以“服務系友、回饋系友、支持母系、共同發展”為宗旨，密切聯系遍布海內外的清華IE校友，搭建聯絡體系，暢通溝通渠道，推動校友活動，促進資源共享和互助合作。
工業工程系自建系至今，累計培養校友4000余人。工業工程系校友兼有工程與管理的基礎，具備良好的溝通、合作及組織管理能力，深受政府機關、科研院所、國內大中型企業、事業單位、外資企業和合資企業青睞，并在國內外諸多領域的重要崗位上發揮著積極的作用。
校友會的最高領導機構是理事會，由系友理事組成。設立常務理事會，由常務理事組成，常務理事由理事長、副理事長和各地系友分會負責人（會長）組成。秘書處是系友會的常設辦事機構，負責統籌秘書處的日常工作。第一屆理事會由前黨委書記林亨擔任理事長，吳甦教授擔任副理事長兼秘書長，蔡臨寧和劉大成副教授擔任副理事長兼副秘書長，吳莉莉擔任校友會秘書。
創業投資協會系友活動
清華IE供應鏈與物流協會活動
IE北美系友活動
IE德國系友活動
官方微信號：THU-IE
