圍繞航空、航天、船舶、兵器、核工業、交通運輸與電子通信等我國重大復雜裝備系統，以需求為導向，研究面向復雜系統全生命周期的復雜系統工程基礎理論、建模方法和分析技術，為需求方提供確保復雜系統成功實現的跨學科方法和手段。中心旨在發展復雜系統工程學科，面向國家重大工程，提升我國系統工程領域在國際上的學術地位及影響力；推進系統工程在工業界的應用和實踐，推動我國重大裝備研制創新以及體系工程能力的快速發展。

研究方向：復雜組織體架構（EA），復雜系統工程（CSE）、體系工程（SoSE）和基于模型的系統工程（MBSE）的方法論、技術、工具及相關應用研究等。